密码科学技术国家重点实验室由国家密码管理局主管，于2014年11月由国家科技部批准建设。

实验室面向国际密码学科发展前沿，面向国家网络空间安全战略需求，围绕密码基础理论、密码工程技术基础、密码测评方法，开展前沿性、前瞻性和战略性研究工作。实验室以建设成为国家密码科技创新高地、密码学术交流高端平台和密码人才培养重点基地为目标，在实验室学术委员会指导下，开展和承担了多项基础性和前沿性科研项目，包括国家重点基础研究计划（973计划）项目、国家自然科学基金重点项目等，并面向国家网络空间安全战略需求，承担了10多项国家级和省部级重大科研项目。实验室目前有固定人员和聘用人员100多人，其中高级职称占百分之六十以上。